Nejlépe se na ostrov dostanete námořní přepravou – trajektem nebo lodí. Pravidelné linky vyplouvají z Pirea a Athén.
Naxos vlastní malé letiště, kam přilétají linky z Athén a některých ostrovů.
Po ostrově je ideální pohybovat se automobilem.
Na své si přijdou i příznivci pěší turistiky. Zdejší terén nabízí různě obtížné trasy, ale hlavně nádherné scenérie.