Napříč malajským poloostrovem vybíhá od severu k jihu pásmo hor, které tvoří jakousi jeho páteř. Rozdělují poloostrov na širokou a úrodnou západní část a na úzké pobřeží na východě.
Klidnější Sabah a Sarawak na Borneu jsou zarostlé hustou tropickou džunglí, s rozsáhlými vodními plochami. Hora Mt. Kinabalu, na ostrově Borneo, je nejen největší horou Malajsie a Bornea, ale zároveň je jednou z největších hor v jižní Asii.
Výhled na Mount Kinabalu z rýžových polí
Více jak 60% území Malajsie dosud tvoří deštný prales. Na těchto místech lze ještě spatřit více jak 8 tisíc druhů rostlin, z toho 2 tisíce druhů stromů, 800 druhů orchidejí a 200 druhů palem.
Malajský tygr
Malajsie je domovem slonů, nosorožců, tygrů, leopardů, tapírů, malajských medvědů, orangutanů, gibbonů. Z říše hmyzu je zde spousta motýlů a brouků, včetně vzácných tesaříků, nosorožíků a zlatohlávků. Východní Malajsie má jednu z nehojnějších a nejrůznorodějších ptačích populací na světě a může se také chlubit pestrým mořských životem.
