Příroda na Bali je dána jeho tropickou polohou. Je velice pestrá a různorodá. Původní vegetaci a přírodu – pobřežní mangrovníkové porosty, monzunové lesy i mohutné pralesní stromy najdete na severozápadě ostrova, kde se nachází národní park Taman National Bali Barat o rozloze 70.000 ha.
Jihozápad je ve znamení palmových hájů, které přecházejí v mangrovníkové porosty. Vnitrozemí ostrova je hornaté, tvořené dvěma sopečnými krátery – posvátným Gunung Agung a Batur se stejnojmenným jezerem.

Sopka Mount Batur a jezero Lake Batur
Díky sopečnému původu je Bali obdařeno nesmírně úrodnou půdou, z níž převážnou část tvoří typická terasovitá rýžová políčka, zabírající asi 20% rozlohy ostrova a připomínající spíše umělecká díla než užitková pole. Terasy jsou uměle zavlažovány a úroda je dvakrát do roka.
Nádherná je i tropická vegetace. Asi 2.000 druhů stromů, obrovské fíkusy, banánovníky a palmy. Kokosové a jiné palmy kromě plodů poskytují i dřevo na stavbu domů, vlákna na střechy i palivo. Ze dřeva jsou i typické suvenýry loutky wayang. Bambus je využíván ke stavbě domů, lešení, mostů až po špejle.

Starobylý banyánový strom
Posvátné jsou dva druhy stromů. Nejvýznamnější je Banyan (Waringin Tree) – roste v chrámech a z jeho vzdušných kořenů vyrůstají stromy nové. Druhým Frangipani (plumérie) poskytuje nádherné květy, kterými se zdobí tanečnice a slouží i jako oběti bohům.

Květ Frangipani (plumérie)
Na Bali je asi 40.000 druhů kvetoucích rostlin včetně 5.000 druhů orchideí a největším květem na světě Rafflesia Arnoldi.
Bali bylo původně domovem velkých savců – slonů, tygrů. Od počátku 20. století zde již žádná velká zvířata nežijí. Při troše štěstí zde můžeme spatřit Komodského varana, přezdívaného také Komodský drak či orangutana.

Makakové v Monkey Forest, Ubud
Faunu zde představují různé druhy opic, především Makak Rhesus, ještěrky – gekoni, které jsou všude a živí se hlavně komáry. Vesničané věří, že přínášejí štěstí. Hojně se zde vyskytuje ptactvo – asi 300 druhů ptáků včetně modrých ledňáčků, mořských orlů, bílých volavek a spousty zpěvných ptáků.
Bali je také domovem tisíce druhů ryb a podmořský svět je jeden z nejkrásnějších na světě. Vidět jsou zde delfíni, žraloci, barevné korálové rybky, malé útesové ryby a murény, stejně jako korýši a houby, což ocení hlavně potápěči. Oblíbené je potápění se žraloky, s rejnoky Manta a měsíčníky, největšími mořskými kostnatými rybami.
Samozřejmě nesmíme zapomenout na domácí zvířectvo, mezi které patří kohouti, slepice, kachny, prasata, krávy a buvoli, jež tvoří ucelený obraz života farmy na Bali.

Bůvol na Bali
Divoká zvěř je různorodá tropické opice, vodní buvol, dobytek, stovky ptáků a hmyzu, hadů, ještěrek, prasata a psi setkávají s velkým počtem všude.